Paulovich - RAS_immunoMRM_Antibody_Development

This data is available under a CC0 1.0 Universal (CC0 1.0) license.

A dataset describing a suite of novel antibody reagents for the RAS signaling network

  • Organism: Homo sapiens
  • Instrument: QTRAP 5500,QTRAP 6500
  • SpikeIn: Yes
  • Keywords: RAS proteins, peptide-based immuno-MRM, monoclonal antibodies
Abstract
RAS genes are frequently mutated in cancer and have for decades eluded effective therapeutic attack. The National Cancer Institute’s RAS Initiative has a focus on understanding pathways and discovering therapies for RAS-driven cancers. Part of these efforts is the generation of novel reagents to enable the quantification of RAS network proteins. Here we present a dataset describing the development, validation (following consensus principles developed by the broader research community), and distribution of 104 monoclonal antibodies (mAbs) enabling detection of 27 phosphopeptides and 69 unmodified peptides from 20 proteins in the RAS network. The dataset characterizes the utility of the antibodies in a variety of applications, including Western blotting, immunoprecipitation, protein array, immunohistochemistry, and targeted mass spectrometry. All antibodies and characterization data are publicly available through the CPTAC Antibody Portal, Panorama Public Repository, and/or PRIDE databases. These reagents will aid researchers in discerning pathways and measuring expression changes in the RAS signaling network.
Created on 12/21/18, 3:30 PM
Clustergrammer Heatmap
Flag FileDownloadCreatedProteinsPeptidesPrecursorsTransitionsReplicatesCalibration Curves
CPTC-RPTOR-2_ALET_2018-07-13_07-32-10.sky.zip2018-12-21 15:32:361121441
CPTC-RPTOR-1_SYNC_2018-07-13_07-31-39.sky.zip2018-12-21 15:32:341121441
CPTC-RAF1-6_STST_2018-07-13_07-31-11.sky.zip2018-12-21 15:32:3312428102
CPTC-RAF1-5_GLQP_2018-07-13_07-30-39.sky.zip2018-12-21 15:32:3011214101
CPTC-RAF1-4_GYAS_2018-07-13_07-30-07.sky.zip2018-12-21 15:32:2811214101
CPTC-RAF1-3_STST_2018-07-13_07-29-32.sky.zip2018-12-21 15:32:2612428102
CPTC-RAF1-2_VVDP_2018-07-13_07-29-04.sky.zip2018-12-21 15:32:241121421
CPTC-RAF1-1_VVDP_2018-07-13_07-28-38.sky.zip2018-12-21 15:32:231121441
CPTC-PTEN-8_NHLD_2018-07-13_07-28-05.sky.zip2018-12-21 15:32:211121421
CPTC-PTEN-7_AQEA_2018-07-13_07-27-38.sky.zip2018-12-21 15:32:191121441
CPTC-PTEN-6_AQEA_2018-07-13_07-27-09.sky.zip2018-12-21 15:32:171121441
CPTC-PTEN-5_AQEA_2018-07-13_07-26-42.sky.zip2018-12-21 15:32:151121441
CPTC-PTEN-4_GVTI_2018-07-13_07-24-42.sky.zip2018-12-21 15:32:131121641
CPTC-PTEN-3_IYNL_2018-07-13_07-24-15.sky.zip2018-12-21 15:32:111121641
CPTC-PTEN-2_NHLD_2018-07-13_07-23-46.sky.zip2018-12-21 15:32:091142851
CPTC-PTEN-1_AQEA_2018-07-13_07-22-55.sky.zip2018-12-21 15:32:071121441
CPTC-MTOR-9_TGTT_2018-07-13_07-22-26.sky.zip2018-12-21 15:32:0514854104
CPTC-MTOR-8_DLEL_2018-07-13_07-21-41.sky.zip2018-12-21 15:32:021121441
CPTC-MTOR-7_IQSI_2018-07-13_07-21-15.sky.zip2018-12-21 15:32:001121441
CPTC-MTOR-6_LTES_2018-07-13_07-20-42.sky.zip2018-12-21 15:31:591121421
CPTC-MTOR-5_LTES_2018-07-13_07-20-14.sky.zip2018-12-21 15:31:571121441
CPTC-MTOR-4_VLGL_2018-07-13_07-19-42.sky.zip2018-12-21 15:31:571121441
CPTC-MTOR-3_LFDA_2018-07-13_07-19-13.sky.zip2018-12-21 15:31:551121441
CPTC-MTOR-2_TGTT_2_2018-10-21_18-10-45.sky.zip2018-12-21 15:31:5314854104
CPTC-MTOR-1_TDSY_2_2018-10-21_18-10-00.sky.zip2018-12-21 15:31:5012434102
CPTC-MAPK3-6_IADP_2018-07-13_07-17-10.sky.zip2018-12-21 15:31:482818146108
CPTC-MAPK3-5_IADP_2018-07-13_07-16-31.sky.zip2018-12-21 15:31:43281814688
CPTC-MAPK3-4_IADP_2018-07-13_07-15-51.sky.zip2018-12-21 15:31:392818146108
CPTC-MAPK3-3_SQQL_2018-07-13_07-14-55.sky.zip2018-12-21 15:31:371121441
CPTC-MAPK3-2_ALDL_2018-07-13_07-14-20.sky.zip2018-12-21 15:31:35112441
CPTC-MAPK3-1_IADP_2_2018-10-21_18-09-09.sky.zip2018-12-21 15:31:332818146108
CPTC-MAPK1-4_VADP_2018-07-13_07-13-18.sky.zip2018-12-21 15:31:302818146108
CPTC-MAPK1-3_VADP_2018-07-13_07-12-45.sky.zip2018-12-21 15:31:26281814688
CPTC-MAPK1-2_VADP_2018-07-13_07-12-09.sky.zip2018-12-21 15:31:22281814688
CPTC-MAPK1-1_VADP_2018-07-13_07-11-26.sky.zip2018-12-21 15:31:182818146108
CPTC-MAP2K1-2_ISEL_2018-07-13_07-09-59.sky.zip2018-12-21 15:31:131121621
CPTC-MAP2K1-1_ISEL_2018-07-13_07-09-24.sky.zip2018-12-21 15:31:121121641
CPTC-GSK3B-9_TTSF_2018-07-13_07-08-06.sky.zip2018-12-21 15:31:1012434102
CPTC-GSK3B-8_VIGN_2018-07-13_07-07-24.sky.zip2018-12-21 15:31:081121441
CPTC-GSK3B-7_VIGN_2018-07-13_07-06-56.sky.zip2018-12-21 15:31:071121421
CPTC-GSK3B-6_TTSF_2_2018-10-21_18-08-25.sky.zip2018-12-21 15:31:0512434102
CPTC-GSK3B-5_VIGN_2018-07-13_07-05-48.sky.zip2018-12-21 15:31:031121441
CPTC-GSK3B-4_VIGN_2018-07-13_07-05-14.sky.zip2018-12-21 15:31:031121441
CPTC-GSK3B-3_TTSF_2_2018-10-21_18-07-48.sky.zip2018-12-21 15:31:0112434102
CPTC-GSK3B-2_TPPE_2018-07-13_07-03-46.sky.zip2018-12-21 15:30:591121841
CPTC-GSK3B-1_LLEY_2018-07-13_07-03-17.sky.zip2018-12-21 15:30:561121441
CPTC-GSK3B-10_TTSF_2018-07-13_07-08-42.sky.zip2018-12-21 15:30:5612434102
CPTC-FOS-4_GSSS_2018-07-13_07-02-49.sky.zip2018-12-21 15:30:541121421
CPTC-FOS-3_APHP_2018-07-13_07-02-25.sky.zip2018-12-21 15:30:521121421
CPTC-FOS-2_TEPF_2018-07-13_07-01-59.sky.zip2018-12-21 15:30:511121421
CPTC-FOS-1_TEPF_2018-07-13_07-01-35.sky.zip2018-12-21 15:30:491121441
CPTC-ERBB3-4_SLEA_2018-07-13_07-01-08.sky.zip2018-12-21 15:30:471121441
CPTC-ERBB3-3_YLER_2018-07-13_07-00-16.sky.zip2018-12-21 15:30:451121421
CPTC-ERBB3-2_LTFQ_2018-07-13_06-59-50.sky.zip2018-12-21 15:30:431121021
CPTC-ERBB3-1_ANDA_2018-07-13_06-59-26.sky.zip2018-12-21 15:30:411121421
CPTC-ERBB2-4_GTPT_2018-12-21_14-15-20.sky.zip2018-12-21 15:30:411242842
CPTC-ERBB2-3_LLDI_2018-07-13_06-58-28.sky.zip2018-12-21 15:30:391121841
CPTC-ERBB2-2_GIWI_2018-07-13_06-57-58.sky.zip2018-12-21 15:30:371121441
CPTC-EGFR-9_GSHQ_2018-07-13_06-53-18.sky.zip2018-12-21 15:30:3512434102
CPTC-EGFR-8_GSHQ_2018-07-13_06-52-37.sky.zip2018-12-21 15:30:331243482
CPTC-EGFR-7_NLQE_2018-07-13_06-52-06.sky.zip2018-12-21 15:30:311121641
CPTC-EGFR-6_IPLE_2018-07-13_06-47-17.sky.zip2018-12-21 15:30:291121631
CPTC-EGFR-5_YSSD_2_2018-10-21_18-06-55.sky.zip2018-12-21 15:30:2713642103
CPTC-EGFR-4_YSSD_2_2018-10-21_18-06-23.sky.zip2018-12-21 15:30:241364283
CPTC-EGFR-3_GSHQ_2_2018-10-21_18-05-45.sky.zip2018-12-21 15:30:2212434102
CPTC-EGFR-2_GSHQ_2_2018-10-21_18-05-10.sky.zip2018-12-21 15:30:1912434102
CPTC-EGFR-1_GSHQ_2_2018-10-21_18-03-01.sky.zip2018-12-21 15:30:1712434102
CPTC-EGFR-13_YSSD_2018-07-13_06-55-58.sky.zip2018-12-21 15:30:1413642103
CPTC-EGFR-12_YSSD_2018-07-13_06-55-27.sky.zip2018-12-21 15:30:1213642103
CPTC-EGFR-11_YSSD_2018-07-13_06-54-42.sky.zip2018-12-21 15:30:091364263
CPTC-EGFR-10_GSTA_2018-07-13_06-53-58.sky.zip2018-12-21 15:30:0712428102
CPTC-CDH2-5_SAAP_2018-07-12_18-39-55.sky.zip2018-12-21 15:30:061121441
CPTC-CDH2-4_SAAP_2018-07-12_18-37-53.sky.zip2018-12-21 15:30:041121421
CPTC-CDH2-3_LSDP_2018-07-12_18-36-50.sky.zip2018-12-21 15:30:031121621
CPTC-CDH2-2_LSDP_2018-07-12_18-35-31.sky.zip2018-12-21 15:30:011121621
CPTC-CDH2-1_LSDP_2018-07-12_18-32-57.sky.zip2018-12-21 15:29:591121641
CPTC-CDH1-5_NTGV_2018-07-12_18-31-29.sky.zip2018-12-21 15:29:571121421
CPTC-CDH1-4_GQVP_2018-07-12_18-29-45.sky.zip2018-12-21 15:29:551121621
CPTC-CDH1-3_GQVP_2018-07-12_18-28-11.sky.zip2018-12-21 15:29:531121621
CPTC-CDH1-2_GLDA_2018-07-12_18-26-57.sky.zip2018-12-21 15:29:521121421
CPTC-CDH1-1_GLDA_2018-07-12_18-25-55.sky.zip2018-12-21 15:29:501121441
CPTC-CCND1-7_AEET_2018-07-10_13-09-22.sky.zip2018-12-21 15:29:481121421
CPTC-CCND1-6_ACQE_2018-07-10_13-08-53.sky.zip2018-12-21 15:29:481122641
CPTC-CCND1-5_AEET_2018-07-10_13-08-23.sky.zip2018-12-21 15:29:461121441
CPTC-CCND1-4_AYPD_2018-07-10_13-07-53.sky.zip2018-12-21 15:29:441121421
CPTC-CCND1-3_AYPD_2018-07-10_13-07-26.sky.zip2018-12-21 15:29:421121421
CPTC-CCND1-2_VIKC_2018-12-19_10-26-33.sky.zip2018-12-21 15:29:401121421
CPTC-CCND1-1_FLSL_2018-07-10_13-06-25.sky.zip2018-12-21 15:29:381121621
CPTC-BRAF-7_GDGG_2018-07-10_13-05-56.sky.zip2018-12-21 15:29:3612430102
CPTC-BRAF-6_GDGG_2_2018-10-21_18-01-53.sky.zip2018-12-21 15:29:3412430102
CPTC-BRAF-5_RDSS_2_2018-10-21_17-07-50.sky.zip2018-12-21 15:29:3114860104
CPTC-BRAF-4_RDSS_2_2018-10-21_17-07-11.sky.zip2018-12-21 15:29:2814860104
CPTC-BRAF-3_AGFQ_2018-07-10_13-03-41.sky.zip2018-12-21 15:29:251144421
CPTC-BRAF-2_GLIP_2018-07-10_13-03-11.sky.zip2018-12-21 15:29:231121441
CPTC-BRAF-1_GLIP_2018-07-10_13-02-43.sky.zip2018-12-21 15:29:211121421
CPTC-ARAF-5_NLGY_2018-07-10_13-02-11.sky.zip2018-12-21 15:29:2014856104
CPTC-ARAF-4_DSGY_2_2018-10-21_17-06-30.sky.zip2018-12-21 15:29:1814856104
CPTC-ARAF-3_TQAD_2018-07-10_13-00-55.sky.zip2018-12-21 15:29:151121441
CPTC-ARAF-2_IGTG_2018-07-10_13-00-08.sky.zip2018-12-21 15:29:131121641
CPTC-ARAF-1_GLNQ_2018-07-10_12-59-24.sky.zip2018-12-21 15:29:121121631